集装箱运输是一种现代化的运输方式，开展集装箱运输需要具备专门的设施和新的技术装备，如集装箱船舶、集装箱专用卡车、集装箱专用列车等，航运公司还需购置或租赁大量造价较高的集装箱。集装箱运输需要有集装箱专用泊位和配套的装卸、堆码、搬运机械设施。这些机械设备与传统的港口设备相比，技术上的要求更高，所投入的资金也明显增多。此外，为适用于大型集装箱专用车辆的通行，内陆运输线路、运载工具和内陆货运站都必须进行改造、兴建、扩建等，这也需要巨额的资金投入。因此，集装箱运输作为一种资金密集型行业，其发展对经济、技术相对落后的发展中国家是较为困难的，这也是集装箱运输在发达国家发展较快的主要原因。

集装箱运输是以国际标准的集装箱为媒介的。天津国际物流公司要及时地掌握集装箱的动态是一项十分复杂的管理业务，通常会由于箱务管理混乱，导致大量集装箱流失。这不仅会造成重大的经济损失，而且会影响运输的正常运行。如何提高集装箱的利用率，加速周转，减少空箱回运，这是集装箱箱务管理的任务。箱务管理的好坏，对降低运输成本，提高经济效益都会产生重大的影响。按照国家的规定，货物的进出口需要办理各种检验手续。如果集装箱运输也与传统的杂货运输那样，必须开箱检查，并且各方都应到场，这势必影响集装箱运输高速、高效的优势。因此，为适应集装箱运输的要求，各方机构必须改革传统的做法，提高工作效率，紧密配合，以确保集装箱运输的畅通无阻。

集装箱船舶为便于装卸，一般设置很大的舱口，从而使船舶纵向变形的适应力小了很多，极易在舱口四角因扭力矩产生集中应力而撕裂。一般而言，集装箱船舶甲板装载集装箱量比较大，占船舶总载箱量的30%~50%，这样会造成船舶重心较高，船舶的稳性因重心提高而受到影响；甲板装载以后，驾驶室的视线受到限制，加大了视野的死角，增加了货运事故的可能性；另外，甲板装载的集装箱极易受风浪的袭击，货损的风险性加大了。虽然存在以上不足，但从整体来看，由于集装箱运输加快了运输速度，减少了货损货差，简化了相关手续，节省了包装费用，增大了通过能力，所以仍是一种经济合理的运输方式。